Microorganismes marins et outils moléculaires 5UM29

Marine microorganisms and molecular tools

ECTS: 6

Responsable(s): C. SIX, N. SIMON

Lieu: Roscoff

Mots clefs:

  • Microorganismes marins
  • Outils moléculaires
  • Diversité taxonomique
  • Adaptation à la niche
  • Interaction biotique

Description rapide:

  • Connaissances précises des différents groupes de microorgansimes marins (eucaryotes, procaryotes, virus) : biodiversité , évolution et adaptations moléculaires, interactions, boucle microbienne, cycles biogéochimiques, quorum sensing.
  • Méthodes de culture des microorganismes marins : isolement, purification, manipulation en conditions stériles, cytométrie de flux, suivis de croissance, etc.
  • Technologies de pointe pour comprendre l’écologie des microorganismes marins : séquençage haut-débit, protéomique, métabolomique, techniques optiques, etc.
  • Méthodes bioinformatiques de génomique comparative et métagénomique : exploration de données et bases de données génomiques pour répondre à des questions écologiques

Keywords:

  • Marine microorganisms
  • Molecular tools
  • Taxonomic diversity
  • Niche adaptation
  • Biotic interaction

Quick description:

  • Advanced knowledge of the different marine microorganisms (eukaryotes, prokaryotes & viruses): biodiversity, evolution & molecular adaptation, Interactions among marine microorganisms, Microbial loop, Biogeochemical cycles, Quorum sensing
  • Culture methods of marine microorganisms: isolation, purification, manipulation under sterile conditions, flow cytometry, growth parametrization, etc.
  • Initiation to advanced technology methods to understand marine microorganism ecology: High throughput sequencing, proteomic, metabolomic, optical techniques, etc.
  • Bioinformatics methods of comparative genomics and metagenomics: exploring whole sequenced genomes and environmental sequence databases to answer ecological questions.